Богатейший фондовый отдел музея, содержащий в себе 520 фондов и множество различных собраний.
Особенно богат рукописный подотдел, называемый Дзерагратун (хранилище рукописей), в котором по последним данным насчитывается 362 536 архивных материала, самым старым образцом которого является Давтар– рукописная тетрадь песен Саят-Новы, созданная в 1750 году. Выше были упомянуты архивы, привезенные основоположником музея Е. Шахазизом, которые пополнялись автографами как восточно и западно-армянских писателей, так и армяно-советских и живущих за пределами Армении созидателей. Ценен фонд основоположника новой армянской литературы, великого просветителя Хачатура Абовяна.
Здесь, кроме рукописи его бессмертного романа «Раны Армении», хранятся и другие образцы черновиков и беловиков, написанные рукою Абовяна,Большое значение имеют полученные писателем письма, авторами которых являются знаменитые иностранные деятели ( Абих, Паррот, Петерман и другие). Как в качественном, так и в количественном отношении ценны также фонды Г. Сундукяна, Т. Азатяна, А. Ширванзаде, Г. Зограпа, М. Мецаренца, О. Туманяна, Е. Чаренца и других писателей.
Рукописи крупнейшего писателя- классика Ованеса Туманяна раскрывают его и как большого поэта, и как детского писателя, исследователя и национального деятеля.
Безмерно впечатляют рукописи нашего другого великого поэта Егише Чаренца, в особенности те сочинения, которые долгие годы оставались погребенными в земле и после извлечения частично восстановлены, но до сих пор часть их хранится в раскрошенном состоянии, как и прах в погребальной урне нашего, не имеющего могилы гения... Неисчерпаемой сокровищницей в области армяно-французских литературных и культурных связей является фонд Аршака Чопаняна, в котором также находятся написанные и полученные им сотни писем на армянском, французском и других языках. Среди полученных писем достаточно перечислить имена таких крупных личностей, как А. Доде, Э. Золя, П. Элэар, С. Маларме, Ф. Маклер, А. Мейе, Р. Роллан, Э. Верхарн, Ф. Верфель А. Франц и множество других.
В этом фондовом подотделе в основных своих проявлениях хранится почти вся армянская литература данного периода. Сюда вошло богатейшее наследство рукописей, принадлежащих целому ряду представителей арменоведения: М. Эмину, Р. Ачаряну, М. Абегяну, Ст. Малхасяну и другим. Здесь находятся рукописные материалы, относящиеся к различным литературным и научным организациям, издательствам, образовательным и культурным учреждениям, а также отдельные собрания, классифицированные по жанрам и характеру. Особенного упоминания заслуживают многочисленные произведения армянских ашугов, собранные как студентами- армянами Дорпатского университета, так и именитым ашугом Дживани. Учитывая все это, данный подотдел, хранящий рукописи, можно считать хронологическим продолжением Маштоцевского Матенадарана.
В других подотделах литературных фондов собраны литературно-мемориальные предметы, составляющие 113 915 архивных материала. Здесь хранятся образцы живописи, личные вещи, фотографии, негативы, марки, материалы мемуарного порядка и т.д. Уникальный портрет Хачатура Абовяна, выполненный маслом, в 1830 году в Дорпате немецким художником Фридрихом Людвигом фон Майделем, является дошедшим до нас единственным изображением великого писателя. Также достоин огромного внимания портрет Егише Чаренца, принадлежавший кисти гениального художника Мартироса Сарьяна, создавшего в 1923 году шедевр, обессмертивший образ великого поэта и ставший на сегодняшний день своеобразным символом музея.
Большую ценность представляют произведения, отображающие современную литературную жизнь и писателей, в творчестве армянских деятелей изобразительного искусства классической школы: Г. Башинджагяна, Ф. Терлемезяна, Е.Тадевосяна, В. Суренянца, А. Гюрджана, Р. Рухкяна, Е. Кочара, художников армянской диаспоры: А. Сарухана, Дева ( Маркар Гарабекян ), фотографов: С. Хандикяна, П. Галиняна, а также работы многих других деятелей искусства, чьи полотна украшают постоянную выставку и временные экспозиции. Для истории современной армянского книгоискусства очень важны художественные оформления Г.Шарбабчяна, К. Тиратуряна.
Богаты личными и семейными фотографиями фонды М. Мецаренца, Интры (Тиран Чракян ), О. Туманяна и многих других. Подотдел изобилует мебелью и предметами личного обихода писателей. В этом смысле значительны фонды Раффи и крупнейшего драматурга Габриела Сундукяна. Долгие годы в музее хранились фрагменты черепа безвременно ушедшего западно-армянского поэта Петроса Дуряна, послужившие основой для восстановления его скульптурного портрета. Работа эта, по возможности документально, была выполнена видным краниологом А. Джагаряном. В феврале 2012 года урна с фрагментами черепа молодого поэта была захоронена в мемориальной стене пантеона парка имени Комитаса. Памятно и дорого кольцо, хранящееся в фонде нашего, также покинувшего этот мир совсем молодым – поэта Мисака Мецаренца. Оно является материнским подарком – чрезмерно выразительным и трогательным…
В состав личних фондов в музей вошли некоторые из личных вещей жертв армянского Геноцида-писателей Григора Зограпа, Сиаманто, Даниела Варужана, Рубена Севака. Принадлежащие этим мученикам вещи, сегодня являются священными реликвиями. В этом же подотделе большое место занимают всевозможные материалы, имеющие тесную связь с современной литературной жизнью: визитки, пригласительные билеты, кондаки (послания армянских католикосов , календари, альбомы и т.д.).